Comment se porte mon intestin ? Cette question est plus présente que jamais, car le microbiome de notre intestin est de plus en plus présent dans notre conscience et est désormais considéré comme responsable de nombreux mécanismes de notre corps. De nombreux facteurs, sur lesquels nous avons sans doute plus d'influence qu'on ne le pensait jusqu'à présent, déterminent si nous allons vivre très vieux. Des recherches récentes indiquent que la flore intestinale joue un rôle déterminant dans la durée de notre vie et dans les maladies dont nous serons atteints.
Nous te montrons dans cet article quel est l'état actuel de la recherche sur le microbiome, si les tests de microbiome en valent vraiment la peine et quel est le rapport entre les acides gras à chaîne courte, comme le butyrate, et la santé.
Qu'est-ce que le microbiome?
Pour commencer, nous devons brièvement clarifier ce qu'est le microbiome. Strinctement, nous possédons différents microbiomes. Partout où se trouvent des bactéries, des virus et des champignons, nous pouvons parler de microbiome. Ce sont par exempleB. le tractus gastro-intestinal (en particulier les intestins), la peau, la bouche, les voies respiratoires et le système urogénital.
Dans cet article, nous allons principalement nous intéresser au microbiome intestinal, notre flore intestinale.
Les missions du microbiome
Le microbiome humain représente un champ d'investigation inépuisable, qui génère chaque jour de nouvelles découvertes scientifiques. Nous en apprenons davantage sur les habitants de notre flore intestinale, sur l'axe intestin-cerveau et sur la manière dont les maladies peuvent éventuellement être traitées par le biais du microbiome. Sans la symbiose entre nos bactéries et notre corps, nous ne pourrions très probablement pas survivre. Le microbiome est z.B. indispensable à l'assimilation de certains nutriments contenus dans les aliments. Le corps humain ne dispose pas à lui seul de l'ensemble des enzymes nécessaires à la dégradation de chaque nutriment.
Les déchets et l'instinct
Le terme microbiome est utilisé comme synonyme de flore intestinale et désigne ici l'ensemble des micro-organismes qui colonisent notre intestin. Ce qui, pour l'organisme humain, n'est souvent considéré que comme un "déchet", comme par exemple les fibres, sert de source de nourriture essentielle à la flore intestinale. La digestion microbienne de ces substances est non seulement vitale pour les bactéries elles-mêmes, mais elle aboutit également à la production de métabolites qui sont très utiles pour la santé humaine, dont des acides biliaires secondaires, des vitamines, des dérivés d'acides aminés et des acides gras à chaîne courte.
En outre, il existe un lien significatif entre le microbiome et le système nerveux entérique - un vaste réseau de neurones qui parcourt tout le tractus gastro-intestinal. Celui-ci est souvent décrit comme le "deuxième cerveau" ou comme la manifestation physique du "sentiment du ventre".
Le saviez-vous?
Les substituts du sucre sont soupçonnés de jouer un rôle dans la résistance à l'insuline, un précurseur du diabète mellitus. Au départ, on espérait que les substituts du sucre pourraient fournir le goût sucré sans les effets négatifs du sucre. Or, cela ne semble pas être le cas. Dans cette étude , les chercheurs ont pu montrer que les édulcorants peuvent modifier le microbiome et ainsi contribuer à l'apparition de la maladie.
Recherches sur le microbiome
Le champ de recherche sur le microbiome est encore assez récent. Cela s'explique notamment par le fait que de nombreuses bactéries présentes dans notre intestin sont des anaérobies stricts. Cela signifie que lorsqu'ils entrent en contact avec l'oxygène, ils meurent presque immédiatement. Pour contourner ce problème, il existe différentes possibilités imaginées par les chercheurs. L'un d'entre eux est le Projet Microbiome Humain.
Projet Microbiome Humain (HMP) - le coup d'envoi de la recherche sur le microbiome
Le Projet Microbiome Humain (HMP) était une initiative pionnière visant à comprendre les communautés microbiennes complexes qui colonisent le corps humain et à étudier leur rôle dans la santé et la maladie. Lancé en 2007 par les National Institutes of Health (NIH) aux États-Unis, il a été l'un des premiers grands programmes de recherche à s'intéresser systématiquement au microbiome humain.
Objectifs du Projet Microbiome Humain
L'objectif principal du HMP était de créer une base de données de référence sur les microbiotes qui habitent différentes parties du corps humain, y compris l'intestin, la bouche, la peau et le tractus urogénital. En utilisant des technologies génomiques de pointe telles que le séquençage de l'ARNr 16S et la métagénomique, le projet visait à cataloguer la diversité génétique des communautés microbiennes et à comprendre leurs fonctions, leurs interactions et leur impact sur la santé humaine.
Connaissances importantes
L'un des principaux résultats du HMP a été la découverte que le microbiome humain présente une énorme diversité et constitue une ressource génétique significative, essentielle à la physiologie humaine. Le projet a révélé que les micro-organismes sont impliqués dans de nombreux processus biologiques importants, notamment :
- Digestion et métabolisme des nutriments
- Développement et fonctionnement du système immunitaire
- Protection contre les micro-organismes pathogènes
- Influence sur la fonction cérébrale et le comportement
En outre, le HMP a montré que les changements dans le microbiome sont liés à une variété de maladies, y compris les maladies inflammatoires chroniques de l'intestin, l'obésité, le diabète, les maladies cardiovasculaires et même les troubles psychiatriques comme la dépression
Sais-tu?
La colonisation de la flore intestinale est un processus qui dure toute la vie, qui commence à la naissance et ne se termine qu'à la mort. Une étude publiée dans "Nature Metabolism" a comparé la flore intestinale de 9000 personnes dans une tranche d'âge de 18 à 101 ans. Les chercheurs ont constaté que ce n'est pas seulement l'homme en soi qui vieillit, mais aussi le microbiome intestinal. Chez des sujets sains âgés de plus de 77 ans, on a constaté des changements dans la flore intestinale, dans laquelle des espèces bactériennes rares dominaient et le modèle microbien habituel diminuait. Chez les sujets moins sains, cette singularité faisait défaut.
Test du microbiome - quelles sont les possibilités?
Le souhait de disposer de tests microbiométriques fiables s'est également développé à partir du HMP. Dans le projet, un séquençage complet du génome, également connu sous le nom de Whole Genome Sequencing (WGS), a été utilisé pour l'analyse du microbiome. L'avantage est que tout est analysé et c'est aussi l'un des inconvénients. Fidèle à l'adage selon lequel "l'arbre cache la forêt", un WGS peut fournir trop d'informations que nous ne pouvons pas encore classer à l'heure actuelle. Peut-être qu'à l'avenir, l'intelligence artificielle permettra de mieux évaluer cette masse d'informations.
Un autre inconvénient du séquençage complet du génome est son coût élevé, tant sur le plan financier que sur celui de la charge de travail. Il existe cependant d'autres tests de microbiome sur le marché:
L'analyse de souches de bactéries
L'analyse de souches de bactéries, souvent réalisée par séquençage de l'ARNr 16S, se concentre sur l'identification et la quantification d'espèces ou de souches bactériennes spécifiques dans un échantillon. Le séquençage du gène de l'ARNr 16S cible une région hautement conservée du génome bactérien, ce qui permet de distinguer différentes souches de bactéries. Imagine que c'est comme un code-barres. Chaque bactérie possède un tel code-barres (l'ARNr 16S) et pour chaque espèce bactérienne, ce code-barres varie toujours un peu. Cela permet aux chercheurs de faire la différence entre différents types de bactéries.
Vous saviez ?
Une fois de plus, expliquons brièvement les termes. Les bactéries sont divisées en familles et en souches. La première partie du mot représente le nom de famille, par ex.B. Bacillus et la deuxième partie du nom représente la souche, dans ce cas Bacillus subtilis. Même si ce nom fait plutôt penser à un agent pathogène, Bacillus subtilis est extrêmement important pour notre santé. Il a même été élu "microbe de l'année 2023". Tu en apprendras plus sur cette bactérie passionnante dans notre article sur QBIOTIC.
Autres tests du microbiome
En plus de ceux déjà mentionnés, il existe quelques autres tests. Les méthodes les plus répandues sont encore le séquençage du métagénome à la torche et la métaprotéomique. La première offre l'avantage, par rapport au séquençage du gène de l'ARNr 16S, d'inclure d'autres organismes, comme les virus ou les champignons. En métaprotéomique, on ne regarde pas la génétique, mais les protéines produites. Ce champ de recherche, également appelé protéomique , est l'un des plus passionnants dans le domaine de la médecine personnalisée et de la longévité. Par rapport à l'épigénétique, où l'on mesure les marqueurs sur l'ADN, la protéomique regarde les protéines fabriquées. C'est aussi sur cette base que se base le dernier test de MoleQlar, avec lequel tu peux connaître ton profil moléculaire. En collaboration avec la prestigieuse LMU de Munich, nous t'offrons un aperçu plus approfondi de ton moi moléculaire.
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Il n'y a pas que les gènes
Le champ de recherche sur le microbiome est extrêmement complexe et est marqué par de nombreuses influences. Un exemple intéressant est la bactérie Eggerthella lenta (E. lenta) DSM 2243, une bactérie présente dans l'intestin humain. E. lenta a une interaction intéressante avec le médicament pour le cœur digoxine. La digoxine a souvent été utilisée pour traiter certains troubles cardiaques tels que l'insuffisance cardiaque et les troubles du rythme cardiaque. Il agit en améliorant l'efficacité du muscle cardiaque et en régulant la fréquence cardiaque. Entre-temps, il n'est plus que rarement utilisé pour les thérapies de ces maladies. L'une des raisons était la difficulté de doser le médicament. Chez certaines personnes, de très petites quantités de digoxine ont fonctionné, tandis que d'autres ont eu besoin d'une dose beaucoup plus élevée. Une explication possible se cache probablement dans notre intestin.
Comment le microbiome influence les médicaments
Bestimmte Stämme von E. lenta sont capables de métaboliser et d'inactiver la digoxine, ce qui réduit l'efficacité du médicament dans l'organisme. Ce métabolisme microbien se fait par l'intermédiaire de l'enzyme Cardiac Glycoside Reductase, qui transforme la digoxine en une forme moins active. Et c'est là qu'un autre facteur entre en jeu pour rendre l'ensemble du contexte plus complexe. Colleen Cutcliffe, une biologiste moléculaire, a déclaré à ce sujet dans le podcast de Peter Attia qu'il y a une différence entre E. lenta possède une copie du gène codant pour l'enzyme, au-dessus de cinq gènes. Les personnes qui ont une E.lenta avec cinq gènes pour l'inactivation de la digoxine semblent répondre nettement moins bien au médicament. Si, à l'avenir, nous pouvons en savoir plus sur ces interactions, ce sera un pas de plus vers la médecine personnalisée.
Comment renforcer le microbiome?
Après avoir appris beaucoup de choses sur le test et le contexte du microbiome, nous nous penchons sur la question de savoir ce que nous pouvons faire pour construire le microbiome, ou plutôt pour l'améliorer. à renforcer.
Avant de nous plonger plus profondément dans le sujet, nous devons encore définir quelques termes : Si tu veux en savoir plus sur chacun d'entre eux, il te suffit de cliquer sur le mot pour accéder à un article détaillé :
- Probiotiques : il s'agit de préparations qui contiennent par ex.B. contiennent des bactéries intestinales vivantes Les probiotiques sont volontiers utilisés pour redonner à la flore intestinale un peu plus de diversité, ou bien pour rétablir l'équilibre entre les "bonnes" et les "mauvaises" bactéries
- Prébiotiques : les prébiotiques sont des substances, généralement des glucides non digestibles comme l'inuline, les fructooligosaccharides (FOS) et les galactooligosaccharides (GOS), qui favorisent sélectivement l'activité ou la croissance de micro-organismes bénéfiques pour la santé dans l'intestin. Tu les trouves dans la nourriture sous forme de fibres et ils servent de "nourriture" à tes bactéries intestinales
Sais-tu?
La Société allemande de nutrition (DGE) recommande aux adultes un apport quotidien d'au moins 30 grammes de fibres. Ces substances se trouvent exclusivement dans les produits végétaux, par exemple dans les fruits et les légumes.B. dans les produits à base de céréales complètes, les fruits et les légumes. Une teneur élevée en fibres dans l'alimentation permet de nourrir suffisamment les bactéries dans l'intestin. Or, la plupart des gens en mangent moins que les 30 grammes recommandés par jour.
- Symbiotiques : les symbiotiques sont des produits ou des compléments alimentaires qui contiennent une combinaison de probiotiques et de prébiotiques . L'idée est que les prébiotiques servent de source de nutriments pour les micro-organismes vivants apportés par les probiotiques, ce qui peut améliorer leur survie, leur implantation et leur efficacité dans le tractus intestinal.
- Postbiotiques : les postbiotiques sont des composés bioactifs produits par l'activité métabolique des micro-organismes probiotiques dans l'intestin. Il s'agit notamment d'acides gras à chaîne courte (comme le butyrate, le propionate et l'acétate), de bactériocines, d'enzymes, de vitamines et d'autres métabolites. Ces substances peuvent avoir des effets positifs sur l'hôte, par exemple en soutenant la fonction de barrière intestinale, en exerçant une action anti-inflammatoire et en modulant le système immunitaire.
Tous ces moyens te permettent de renforcer ta flore intestinale. Le plus simple est sans doute d'adapter son alimentation en augmentant la quantité de fibres. Si tu ne consommes pas encore beaucoup de fibres par jour, il est préférable d'augmenter progressivement la quantité, sinon tu risques d'avoir des ballonnements ou des problèmes gastro-intestinaux. Pour en savoir plus sur ce sujet, consulte notre article sur Constituer la flore intestinale.
Le métabolisme du butyrate - pas seulement important pour la santé intestinale
Le métabolisme du butyrate fait référence au processus biochimique par lequel certains micro-organismes présents dans l'intestin humain fermentent les glucides indigestes (en particulier les fibres alimentaires) et produisent des acides gras à chaîne courte (AGCC) comme le butyrate. Le butyrate présente un intérêt particulier car il a de multiples effets positifs sur notre santé, notamment la promotion de la santé intestinale, le renforcement de la fonction de barrière de l'intestin, des effets anti-inflammatoires et des mécanismes de protection potentiels contre les maladies métaboliques, comme le diabète sucré de type 2.
Production de butyrate dans l'intestin
La production de butyrate résulte de la fermentation de fibres par des bactéries anaérobies dans le gros intestin. Ces bactéries, qui comprennent des genres comme Faecalibacterium, Eubacterium, Roseburia et Butyrivibrio, utilisent les fibres alimentaires comme source d'énergie et produisent ainsi des AGCS, dont le butyrate. Le butyrate sert alors de source d'énergie principale aux cellules de la muqueuse intestinale (colonocytes) et soutient leur santé et leur fonction. D'ailleurs, les cellules de la muqueuse intestinale sont les seules cellules du corps à pouvoir utiliser le butyrate comme source d'énergie.
Tu savais?
Tu connais peut-être le "remède miracle pour maigrir" Ozempic, également connu sous le nom de "seringue pour maigrir". En fait, ce terme cache un médicament contre le diabète sucré qui imite une hormone dans le corps. Pour être plus précis, le GLP-1 (Glucagon-like Peptid-1). Pour en savoir plus, consulte l'article sur Berberin. Mais revenons au microbiome. Le butyrate produit par les bactéries peut stimuler les cellules L de l'intestin, qui produisent à leur tour l'hormone GLP-1. De ce fait, une alimentation riche en fibres peut indirectement augmenter la sécrétion de GLP-1 en stimulant la production de butyrate et donc avoir des effets positifs sur le métabolisme du glucose et la régulation de l'appétit.
Berbérine biodisponible avec chrome et zinc dans le complexe minéral Berbersome
Le rôle de Bacillus subtilis
Bacillus subtilis, souvent cité comme bactérie probiotique, joue un rôle légèrement différent dans le microbiome par rapport aux producteurs directs de butyrate. B. subtilis est une bactérie gram-positif vivant dans le sol, que l'on peut également trouver dans l'intestin humain. Il est connu pour sa capacité à produire des endospores robustes qui lui permettent de résister à des conditions environnementales difficiles. Obwohl B. subtilis n'est pas directement impliqué dans la production de butyrate, il peut néanmoins avoir des effets indirects sur le métabolisme du butyrate et la santé générale de l'intestin:
- Promouvoir une flore intestinale saine: B. subtilis peut soutenir la croissance et l'activité des bactéries productrices de butyrate dans l'intestin en favorisant la diversité microbienne et l'équilibre écologique.
- Stimulation du système immunitaire : B. subtilis peut moduler la réponse immunitaire et contribuer à l'intégrité de la barrière intestinale, ce qui peut indirectement améliorer l'environnement pour la production de butyrate.
- Concurrence avec les micro-organismes pathogènes : grâce à ses propriétés antimicrobiennes, B. subtilis inhibent la croissance des bactéries nocives, ce qui favorise une flore intestinale plus saine, laquelle favorise à son tour la production de butyrate.
Toutes ces caractéristiques ont contribué à faire de B.subtilis a été désigné microbe de l'année 2023.
Le microbiome et son rôle dans la longévité
Plus nous vieillissons, plus notre microbiome perd de sa diversité. Dans le pire des cas, la symbiose se transforme en dysbiose. Les modifications du microbiome peuvent être si graves qu'elles ont été enregistrées comme l'un des Hallmarks of Aging . Celles-ci décrivent les changements moléculaires qui accompagnent le vieillissement. L'espoir est que si nous parvenons à inverser ces repères, nous pourrons également arrêter le vieillissement.
Fazit
"...un intestin malade est la racine de tous les maux...", Hippocrate le savait déjà. Un intestin intact est extrêmement important pour notre santé et notre longévité. Comprendre la composition moléculaire de la flore intestinale est un défi que nous devons maintenant relever. Notre microbiome est un domaine de recherche hautement complexe et passionnant. Grâce aux méthodes récentes d'analyse génétique et de protéomique, nous avons fait un pas en avant pour mieux comprendre notre flore intestinale. À l'avenir, la médecine personnalisée pourrait également s'accompagner du microbiome.
