Comment vont réellement mes intestins ? Cette question est plus que jamais présente, car le microbiome de notre intestin prend de plus en plus conscience de nous et est désormais considéré comme responsable de nombreux mécanismes de notre organisme. De nombreux facteurs déterminent si nous devenons anciens, et nous avons probablement plus d’influence sur eux qu’on ne le pensait auparavant. Les dernières recherches indiquent que la flore intestinale joue un rôle important dans la durée de notre vie et dans les maladies dont nous souffrirons.
Dans cet article, nous vous montrerons l'état actuel de la recherche sur le microbiome, si les tests sur le microbiome valent la peine et ce que les acides gras à chaîne courte, comme le butyrate, ont à voir avec la santé.
Qu'est-ce que le microbiote ?
Pour commencer, nous devons clarifier brièvement ce qu’est réellement le microbiome. À proprement parler, nous avons des microbiomes différents. Partout où se trouvent des bactéries, des virus et des champignons, nous pouvons parler de microbiome. Il s'agit par exemple du tractus gastro-intestinal (en particulier les intestins), de la peau, de la bouche, des voies respiratoires et du système urogénital.
Dans cet article nous nous concentrerons principalement sur le microbiome intestinal, notre flore intestinale.
Les tâches du microbiome
Le microbiome humain représente un champ de recherche inépuisable qui produit chaque jour de nouvelles découvertes scientifiques. Nous en apprenons davantage sur les habitants de notre flore intestinale, sur l’axe intestin-cerveau et sur la manière dont les maladies peuvent éventuellement être traitées via le microbiome. Sans la symbiose entre nos bactéries et notre corps, nous ne pourrions probablement pas survivre. Par exemple, le microbiome est essentiel à l’assimilation de certains nutriments issus des aliments. Le corps humain à lui seul ne dispose pas de la gamme complète d’enzymes nécessaires pour décomposer tous les nutriments.
Déchets et intuition
Le terme microbiome est utilisé comme synonyme de flore intestinale et désigne l’ensemble des micro-organismes qui peuplent nos intestins. Ce qui n’est souvent que du « déchet » pour l’organisme humain par exemple fibre, est considéré comme une source essentielle de nutrition pour la flore intestinale. La digestion microbienne de ces substances est non seulement vitale pour les bactéries elles-mêmes, mais aboutit également à la production de métabolites très bénéfiques pour la santé humaine, y compris les acides biliaires secondaires, les vitamines, les dérivés d'acides aminés et les acides gras à chaîne courte.
Il y en a aussi un lien significatif entre le microbiome et le système nerveux entérique – un vaste réseau de neurones qui traverse tout le tractus gastro-intestinal. Ceci est souvent décrit comme le « deuxième cerveau » ou la manifestation physique de la « sensation instinctive ».
Saviez-vous?
Les substituts du sucre sont soupçonnés de jouer un rôle Résistance à l'insuline, un précurseur du diabète sucré, pour jouer. On espérait à l’origine que les substituts du sucre pourraient offrir un goût sucré sans les effets négatifs du sucre. Toutefois, cela ne semble pas être le cas. Dans celui-ci étude Les chercheurs ont pu montrer que les édulcorants peuvent modifier le microbiome et ainsi contribuer au développement de la maladie.
Recherche sur le microbiome
Le domaine de la recherche sur le microbiome est encore assez jeune. C'est notamment parce que De nombreuses bactéries présentes dans nos intestins sont des anaérobies stricts. Cela signifie que s’ils entrent en contact avec l’oxygène, ils meurent presque immédiatement. Pour contourner ce problème, les chercheurs ont imaginé différentes solutions. L'un d'eux est celui-ci Projet sur le microbiome humain.
Human Microbiome Project (HMP) – le signal de départ pour la recherche sur le microbiome
Le Human Microbiome Project (HMP) était une initiative révolutionnaire visant à comprendre les communautés microbiennes complexes qui peuplent le corps humain et à explorer leur rôle dans la santé et la maladie. Lancé en 2007 par les National Institutes of Health (NIH) aux États-Unis, il s’agit de l’un des premiers grands programmes de recherche à s’intéresser systématiquement au microbiome humain.
Objectifs du projet Microbiome Humain
L’objectif principal du HMP était de créer une base de données de référence sur le microbiote qui habite différentes parties du corps humain, notamment l’intestin, la bouche, la peau et le tractus urogénital. En utilisant des technologies génomiques de pointe telles que le séquençage de l’ARNr 16S et la métagénomique, le projet a cherché à cataloguer la diversité génétique des communautés microbiennes et à comprendre leurs fonctions, leurs interactions et leur impact sur la santé humaine.
Informations clés
L’un des principaux résultats du HMP a été la reconnaissance du fait que le microbiome humain présente une énorme diversité et représente une ressource génétique importante essentielle à la physiologie humaine. Le projet a révélé que les micro-organismes sont impliqués dans de nombreux processus biologiques importants, notamment :
- Digestion et métabolisme des nutriments
- Développement et fonction du système immunitaire
- Protection contre les micro-organismes pathogènes
- Influencer la fonction cérébrale et le comportement
De plus, le HMP a montré que les modifications du microbiome sont liées à diverses maladies, notamment les maladies inflammatoires de l'intestin, l'obésité, le diabète, les maladies cardiovasculaires et même des troubles psychiatriques tels que la dépression.
Saviez-vous?
La colonisation de la flore intestinale est un processus qui dure toute la vie et qui commence dès la naissance et ne se termine qu’avec la mort. Dans une étude publiée dans «Métabolisme naturel», la flore intestinale de 9 000 personnes âgées de 18 à 101 ans a été comparée. Les chercheurs ont découvert que non seulement les personnes vieillissent, mais aussi le microbiome de l’intestin. Chez les sujets sains de plus de 77 ans, des modifications de la flore intestinale ont été constatées, dans lesquelles des espèces bactériennes rares prédominaient et le schéma habituel du microbiome diminuait. Cette unicité était absente chez les sujets en moins bonne santé.
Test du microbiome – quelles sont les options ?
Le HMP a également suscité le désir de disposer de tests microbiologiques fiables. Dans le cadre du projet, une analyse du microbiome a été réalisée Le séquençage complet du génome, également appelé séquençage du génome entier (WGS), est utilisé.L’avantage c’est que tout est analysé et c’est aussi un des inconvénients. Fidèle au dicton : «On ne voit plus la forêt à cause des arbres», un WGS peut offrir trop d’informations que, à ce jour, nous ne pouvons pas encore classer. Peut-être qu’à l’avenir il sera possible de mieux évaluer cette richesse d’informations grâce à l’intelligence artificielle.
Un autre inconvénient du séquençage complet du génome est que coûts élevés, tant sur le plan financier qu'en termes de charge de travail. Il existe également d’autres tests de microbiome sur le marché :
Analyse de souches de bactéries
L'analyse des souches de bactéries, souvent réalisée à l'aide de Séquençage de l'ARNr 16S, se concentre sur l’identification et la quantification d’espèces ou de souches bactériennes spécifiques dans un échantillon. Le séquençage du gène de l’ARNr 16S cible une région hautement conservée du génome bactérien, permettant ainsi la discrimination entre différentes souches bactériennes. Pensez-y comme à un code-barres. Chaque bactérie possède un tel code-barres (l'ARNr 16S) et ce code-barres varie toujours un peu pour chaque type de bactérie. Cela permet aux chercheurs de distinguer différents types de bactéries.
Saviez-vous?
Une explication rapide du terme. Les bactéries sont divisées en familles et phylums. La première partie du mot représente le nom de famille, par exemple Bacillus, et la deuxième partie du nom représente la tribu, dans ce cas. Bacillus subtilis. Même si ce nom fait plutôt penser à un agent pathogène, Bacillus subtilis est extrêmement important pour notre santé. Il est même devenu le «Microbe de l'année 2023" choisi. Vous pouvez en savoir plus sur cette bactérie passionnante dans notre article QBIOTIQUE.
Plus de tests sur le microbiome
En plus de ceux déjà mentionnés, il existe quelques autres tests. Ils sont encore répandus Séquençage du métagénome et métaprotéomique du fusil de chasse. Par rapport au séquençage du gène de l’ARNr 16S, le premier offre l’avantage d’inclure également d’autres organismes, tels que des virus ou des champignons. Avec la métaprotéomique, on ne regarde pas la génétique, mais les protéines produites. Ce domaine de recherche aussi Protéomique appelé, est l’un des plus passionnants dans le domaine de la médecine personnalisée et de la longévité. Comparé au Épigénétique, où les marqueurs de l'ADN sont mesurés, la protéomique examine les protéines produites. Le dernier test de MoleQlar est basé sur ceci, avec lequel vous pouvez connaître votre profil moléculaire. En collaboration avec le célèbre LMU Munich, nous vous offrons un aperçu plus approfondi de votre moi moléculaire.
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Ce n'est pas seulement les gènes
Le domaine de la recherche sur le microbiome est très complexe et est façonné par de nombreuses influences. Un exemple intéressant est la bactérie Eggerthella lenta (E.lente) DSM 2243, une bactérie présente dans l'intestin humain. E. lenta a une interaction intéressante avec la digoxine, un médicament pour le cœur. La digoxine a été largement utilisée pour traiter certaines maladies cardiaques telles que l'insuffisance cardiaque et les battements cardiaques irréguliers. Il agit en améliorant l’efficacité du muscle cardiaque et en régulant la fréquence cardiaque. Il n’est aujourd’hui que rarement utilisé pour traiter ces maladies. L’une des raisons était le dosage difficile du médicament. Même de petites quantités de digoxine ont fonctionné pour certaines personnes, tandis que pour d’autres, il fallait une dose beaucoup plus élevée. Une explication possible est probablement cachée dans nos intestins.
Comment le microbiome influence les médicaments
Particulier Les souches d'E. lenta sont capables de métaboliser la digoxine et inactiver, ce qui réduit l'efficacité du médicament dans le corps. Ce métabolisme microbien se produit grâce à l’enzyme glycoside réductase cardiaque, qui convertit la digoxine en une forme moins active. Et ici, un autre facteur entre en jeu et rend l’ensemble du lien plus complexe. Colleen Cutcliffe, biologiste moléculaire, a déclaré sur le podcast de Peter Attia que le fait qu'E. lenta possède une copie du gène qui code pour l'enzyme sur cinq gènes fait une différence. Les personnes qui ont une forme E.lenta avec cinq gènes pour inactiver la digoxine semblent répondre beaucoup moins bien au médicament. Si nous parvenons à en savoir plus sur ces interactions à l’avenir, ce sera un pas supplémentaire vers une médecine personnalisée.
Comment renforcer le microbiome ?
Maintenant que nous avons beaucoup appris sur les tests et sur le contexte du microbiome, explorons la question de savoir ce que nous pouvons faire pour construire ou renforcer le microbiome.
Avant d'approfondir le sujet, nous devons définir quelques termes : Si vous souhaitez en savoir plus sur les différents sujets, vous pouvez simplement cliquer sur le mot et vous serez redirigé vers un article détaillé :
- Probiotiques: Ce sont des préparations qui contiennent, par exemple, des bactéries intestinales vivantes. Les probiotiques sont souvent utilisés pour rendre la flore intestinale un peu plus diversifiée ou pour rétablir l’équilibre entre les « bonnes » et les « mauvaises » bactéries.
- Prébiotiques: Les prébiotiques sont des substances, principalement les glucides non digestibles comme Inuline, fructooligosaccharides (FOS) et galactooligosaccharides (GOS), qui favorisent sélectivement l'activité ou la croissance de micro-organismes favorables à la santé dans l'intestin. Vous les trouvez dans votre alimentation sous forme de fibres et elles servent de « nourriture » à vos bactéries intestinales.
Saviez-vous?
Le La Société allemande de nutrition (DGE) recommande un apport quotidien d'au moins 30 grammes de fibres pour les adultes.. Ces substances ne peuvent être trouvées que dans les produits végétaux, comme les produits à grains entiers, les fruits et légumes. Une teneur élevée en fibres dans les aliments garantit que les bactéries présentes dans l'intestin reçoivent suffisamment de nutrition. Cependant, la plupart des gens mangent moins que les 30 grammes recommandés par jour.
- Symbiotiques: Les symbiotiques sont des produits ou compléments alimentaires qui... Combinaison de probiotiques et de prébiotiques contenir.L'idée derrière cela est que les prébiotiques servent de source de nutriments pour les micro-organismes vivants fournis avec les probiotiques, ce qui peut améliorer leur survie, leur colonisation et leur efficacité dans le tractus intestinal.
- Postbiotiques: Les postbiotiques sont des composés bioactifs produits par l'activité métabolique des micro-organismes probiotiques dans l'intestin. Cela comprend acides gras à chaîne courte (tels que le butyrate, le propionate et l'acétate), bactériocines, enzymes, vitamines et autres métabolites. Ces substances peuvent avoir des effets positifs sur l’hôte, par exemple en soutenant la fonction de barrière intestinale, en ayant un effet anti-inflammatoire et en modulant le système immunitaire.
Vous pouvez renforcer votre flore intestinale de toutes ces manières. Le plus simple est probablement d’ajuster votre alimentation en ajoutant davantage de fibres. Si vous ne consommez pas actuellement beaucoup de fibres par jour, il est préférable d’augmenter la quantité lentement, sinon vous pourriez avoir des ballonnements ou des problèmes gastro-intestinaux. Vous pouvez en savoir plus sur le sujet dans notre article Construire la flore intestinale.
Le métabolisme du butyrate – non seulement important pour la santé intestinale
Le métabolisme du butyrate fait référence au processus biochimique par lequel certains micro-organismes de l'intestin humain fermentent les glucides non digestibles (en particulier les fibres) et ainsi acides gras à chaîne courte (AGCC) comme la production de butyrate. Le butyrate est particulièrement intéressant car il a de nombreux effets positifs sur notre santé, notamment la promotion de la santé intestinale, le renforcement de la fonction de barrière intestinale, des effets anti-inflammatoires et des mécanismes de protection potentiels contre les maladies métaboliques telles que le diabète sucré de type 2.
Production de butyrate dans l'intestin
La production de butyrate se fait par le Fermentation des fibres par des bactéries anaérobies dans le gros intestin. Ces bactéries, qui comprennent des genres tels que Faecalibacterium, Eubacterium, Roseburia et Butyrivibrio, utilisent les fibres comme source d'énergie et produisent ainsi des SCFA, notamment du butyrate. Le butyrate constitue alors la principale source d'énergie pour les cellules de la muqueuse intestinale (colonocytes) et soutient leur santé et leur fonctionnement. À propos : les cellules de la muqueuse intestinale sont les seules cellules du corps capables d’utiliser le butyrate comme source d’énergie.
Saviez-vous?
Peut-être connaissez-vous le « médicament miracle pour perdre du poids » Ozempic, également connue sous le nom d’injection de perte de poids. En fait, il s’agit d’un médicament contre le diabète sucré qui imite une hormone présente dans le corps. Pour être précis, cela GLP-1 (peptide-1 de type glucagon). Vous pouvez en savoir plus à ce sujet dans l'article sur Berbérine. Mais revenons au microbiome. Le butyrate produit par la bactérie peut stimuler les cellules L de l’intestin, qui à leur tour produisent l’hormone GLP-1. Par conséquent, une alimentation riche en fibres peut augmenter indirectement la sécrétion de GLP-1 en stimulant la production de butyrate. et ont ainsi des effets positifs sur le métabolisme du glucose et la régulation de l'appétit.
Berbérine biodisponible avec chrome et zinc dans le complexe minéral Berbersome
Le rôle de Bacillus subtilis
Bacillus subtilis, souvent cité comme bactérie probiotique, joue un rôle légèrement différent dans le microbiome de celui des producteurs directs de butyrate. B. subtilis est une bactérie à Gram positif vivant dans le sol et que l'on retrouve également dans l'intestin humain. Il est connu pour sa capacité à former des endospores robustes, lui permettant de survivre à des conditions environnementales difficiles. Bien que B. subtilis ne soit pas directement impliqué dans la production de butyrate, il peut néanmoins avoir des effets indirects sur le métabolisme du butyrate et la santé intestinale globale :
- Favoriser une flore intestinale saine : B. subtilis peut soutenir la croissance et l’activité des bactéries productrices de butyrate dans l’intestin en favorisant la diversité microbienne et l’équilibre écologique.
- Stimulation du système immunitaire: B. subtilis peut moduler la réponse immunitaire et contribuer à l'intégrité de la barrière intestinale, ce qui peut indirectement améliorer l'environnement pour la production de butyrate.
- Compétition avec les micro-organismes pathogènes: Grâce à ses propriétés antimicrobiennes, B. subtilis peut inhiber la croissance de bactéries nocives, favorisant ainsi une flore intestinale plus saine, ce qui favorise la production de butyrate.
Toutes ces propriétés ont contribué à ce que B.subtilis soit nommé Microbe de l’année en 2023.
Le microbiome et son rôle dans la longévité
Plus nous vieillissons, plus notre microbiome perd en diversité. Dans le pire des cas, une symbiose devient une Dysbiose. Les changements dans le microbiome peuvent être si graves qu’ils sont considérés comme l’un des Les caractéristiques du vieillissement ont été enregistrés. Ceux-ci décrivent les changements moléculaires qui se produisent avec l’âge. L’espoir est que si nous parvenons à inverser ces caractéristiques, nous pourrons également arrêter le vieillissement.
Conclusion
« …un intestin malade est la racine de tous les maux… » Hippocrate le savait déjà. Un intestin intact est extrêmement important pour notre santé et notre longue vie. Comprendre la composition moléculaire de la flore intestinale est un défi qu’il nous faut aujourd’hui relever. Notre Le microbiome est un domaine de recherche très complexe et passionnant. Grâce aux nouvelles méthodes d’analyse génétique et de protéomique, nous avons fait un pas de plus vers une meilleure compréhension de notre flore intestinale.. À l’avenir, la médecine personnalisée pourrait également être liée au microbiome.
