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¿Qué es la proteómica?
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¿Qué es la proteómica?

El proteómica es todavía un área de investigación bastante joven la totalidad de todas las proteínas (proteoma) mira más de cerca e intenta descubrir qué proteínas se encuentran en las células, qué funciones tienen y cómo trabajan juntas. Todo nuestro cuerpo está formado por miles de proteínas diferentes. Y enzimas, que también están compuestos de proteínas, regulan importantes procesos metabólicos.

Con la ayuda de la proteómica podemos crear una especie de biblioteca enorme en la que se clasifican y clasifican las proteínas. Esto es lo que obtenemos una mejor comprensión de las conexiones en nuestro cuerpo y puede comprender qué procesos se alteran en las enfermedades o cómo afectan los medicamentos al cuerpo. En este artículo te mostraremos de forma comprensible qué es la proteómica, qué tiene que ver con la epigenética y cómo podemos utilizar esta tecnología.

¿Qué es la proteómica?

Está formulado con bastante sobriedad. La proteómica es el estudio y análisis integral del proteoma, es decir, la totalidad de todas las proteínas que se expresan en una célula, un tejido, un organismo o un sistema biológico específico en un momento específico. Se ocupa de la identificación, cuantificación, estructura, función e interacciones de proteínas, así como de sus cambios en diferentes condiciones.

Mediante el uso de tecnologías avanzadas como la espectrometría de masas y herramientas bioinformáticas, la proteómica tiene como objetivo Obtener una comprensión detallada del papel de las proteínas en los procesos biológicos y las enfermedades. y, por lo tanto, contribuye significativamente al desarrollo de nuevos métodos de diagnóstico, terapias y la comprensión de los mecanismos de las enfermedades.

El proteoma como el guardarropa de tu vida

Proteómica: ¿podría ser más comprensible?

Es cierto que el complejo trasfondo de la proteómica no es fácil de explicar. En nuestro artículo sobre el Epigenética tenemos estos con el Controles de volumen comparado. Para la proteómica podemos usar una analogía diferente: un armario.

Imagina que tu armario está lleno hasta los topes de diferentes prendas, cada una de las cuales cumple una función específica. Cada Prenda representa uno proteína en tu cuerpo, y el La totalidad de todas las proteínas (o su guardarropa) se llama proteoma. designado.

Al igual que un guardarropa, el proteoma puede ser diverso, con una amplia gama de proteínas responsables de diferentes funciones y procesos celulares. Algunas proteínas son como tu ropa favorita., que usas a menudo y que juegan un papel importante en tu vida diaria. Aquí lo harías desde proteínas esenciales hablar.

Otras proteínas son como las prendas de vestir raramente usadas o de temporada que solo se necesitan para determinadas ocasiones.

El guardarropa de la vida

Así como organizas tu armario según tus necesidades y eliges determinadas prendas que se adaptan a tu estilo, tu cuerpo regula la expresión y actividad de diferentes proteínas dependiendo de las necesidades y condiciones. Este proceso se llama proteómica. e implica el estudio y análisis de todas las proteínas de una célula, tejido u organismo en un momento dado.

Por ejemplo, cuando hace ejercicio, su cuerpo puede producir proteínas que son importantes para la recuperación muscular y la construcción de nueva masa muscular. Estas proteínas se activan para satisfacer las necesidades específicas de tu entrenamiento. Similar a cómo elegirías tu ropa deportiva.Para prepararte para tu sesión de entrenamiento, tu cuerpo selecciona determinadas proteínas para facilitar las adaptaciones fisiológicas al entrenamiento.

La proteómica nos permite estudiar la compleja interacción de las proteínas en sistemas biológicos y comprender cómo responden a diversos factores ambientales, enfermedades o intervenciones terapéuticas. Al analizar el proteoma, podemos obtener información sobre cómo funcionan las células y los tejidos y descubrir nuevas posibilidades para diagnosticar, tratar y prevenir enfermedades. Para seguir con la analogía, examinamos qué “prendas de vestir” se utilizan en qué situaciones de la vida.

¿Por qué utilizas la proteómica?

La proteómica ofrece un tipo “Visión en vivo” de la célula. Con la genética hasta ahora sólo hemos podido hacer visibles los planos. Gracias a la proteómica ahora es posible obtener una nueva perspectiva. Podemos ver si las proteínas vuelven a cambiar después de su traducción, por ejemplo mediante fosforilación o glicosilación. Esto significa que obtenemos una visión más detallada de los procesos de la célula. De esta manera, los investigadores también pueden investigar mejor las interacciones proteína-proteína y así comprender mejor las complejas vías de señalización biológica.

¿Cuáles son las ventajas de la proteómica?

La proteómica es el siguiente paso hacia una medicina más personalizada. Los esfuerzos de investigación pueden hacer posible en el futuro identificar mejor nuevos biomarcadores de enfermedades o moléculas diana terapéuticas. También podemos utilizar la proteómica para aumentar nuestra comprensión de cómo las drogas afectan al cuerpo.

La investigación aún se encuentra en sus primeras etapas, pero ya existen algunos estudios muy interesantes. en este estudiar Se hicieron pruebas a 36 personas con diferentes condiciones antes y después del ejercicio. Los análisis fueron extremadamente extensos, desde análisis de sangre hasta análisis de proteoma y genéticos. Los investigadores pudieron determinar que algunas proteínas eran adecuadas como marcadores para el rendimiento posterior en pruebas de resistencia. También descubrieron que las personas con... resistencia a la insulina mostrar una reacción diferente al deporte. Es necesario realizar un poco más de investigación antes de poder derivar enfoques de tratamiento precisos a partir de esto, pero los resultados hasta ahora son extremadamente interesantes.

¿Cómo se miden las proteínas?

Existen diferentes métodos para medir las proteínas. Un espectrómetro de masas es de gran importancia para la proteómica. Pero, ¿cómo funciona un dispositivo así?

Un espectrómetro de masas es como un escalas sofisticadas, que clasifica partículas diminutas como proteínas o péptidos (cortes de proteína) según su peso. Imagina que tienes una bolsa con pelotas de diferentes tamaños y quieres organizarlas según su tamaño. Un espectrómetro de masas esencialmente hace lo mismo, solo que con moléculas.. Para darle una mejor idea del proceso que hay detrás, hemos presentado los pasos de trabajo individuales de la forma más sencilla posible:

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Paso 1: Preparar la muestra

Primero, las proteínas se extraen de una muestra de célula o tejido. Debido a que las proteínas son demasiado grandes y complejas para analizarlas directamente, se “descomponen” en partes más pequeñas llamadas péptidos mediante un proceso llamado digestión (similar a comer).

Paso 2: ionización

Luego, los péptidos se introducen en el espectrómetro de masas donde se ionizan. Esto significa que los péptidos se cargan eléctricamente, similar a cuando frotas globos en tu cabello y luego se "pegan" a la pared.

Paso 3: vuelo a través del espectrómetro de masas

Los péptidos cargados se envían a través del espectrómetro de masas. El dispositivo utiliza campos eléctricos para acelerar los péptidos. Cuanto más ligero es un péptido, más rápido se mueve a través del dispositivo. Es como soplar bolas de diferentes tamaños a través de un túnel de viento; los más pequeños vuelan más rápido que los más grandes.

Paso 4: Detección

Al final del “vuelo”, los péptidos llegan a un detector. El detector mide la rapidez con la que llegó cada péptido, lo que indica su peso (más específicamente, la relación masa-carga). Esta información se presenta en un espectro que parece un diagrama de montañas, con picos correspondientes a diferentes péptidos.

Paso 5: Analizar los datos

Los datos recopilados (el espectro de masas) se comparan con una base de datos que contiene información sobre péptidos y proteínas conocidos. A través de esta comparación, los científicos pueden descubrir qué proteínas estaban presentes en la muestra y en qué cantidades.

Entonces, un espectrómetro de masas funciona como una balanza muy precisa: rompe las proteínas en pedazos más pequeños, carga esos pedazos eléctricamente, luego los hace volar a través de un dispositivo y mide qué tan rápido se mueven. Esta información nos ayuda a comprender qué proteínas están presentes en una célula o tejido y cómo funcionan.

Conclusión sobre la proteómica.

La proteómica es todavía un campo de investigación relativamente joven. Uno de los primeros artículos sobre este tema apareció en el renombrado Lancet Journal en 2000 con el título: “Preotómica: nuevas perspectivas, nuevas oportunidades biomédicas“.

Desde entonces han sucedido muchas cosas en la investigación. Los métodos se han vuelto cada vez más sofisticados y baratos, lo que ha hecho posible explorar la proteómica a mayor escala.Con la ayuda de la inteligencia artificial (IA), la ciencia puede analizar mejor enormes cantidades de datos, etc. Usar la proteómica para descubrir nuevos biomarcadores o desarrollar nuevas terapias.

Fuentes

Literatura

  • Hanash, Sam. Proteómica de las enfermedades.Nature  422,6928 (2003): 226-32. Link
  • Marcassa, Gabriele et al. Caracterización de sinapsis basada en la proteómica: de las proteínas a los circuitos.”Opinión actual en neurobiología  79 (2023): 102690. Link
  • Contrepois, Kévin et al. Coreografía molecular del ejercicio agudo.Cell  181.5 (2020): 1112-1130.e16. Link
  • Banks, R E et al. “Proteómica: nuevas perspectivas, nuevas oportunidades biomédicas.”Lancet (Londres, Inglaterra) 356,9243 (2000): 1749-56. Link

Grafiken

Las imágenes fueron adquiridas bajo licencia de Canva.

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